Vuonna 1798 ranskalainen kemisti Vauquelin Niclas Louis (1763-1829) löysi berylliumin, kun hän suoritti kemiallisen analyysin berylistä ja smaragdeista. Alkuaineberylliumia saatiin kuitenkin kolmekymmentä vuotta myöhemmin, vuonna 1828, saksalainen kemisti Friedrich Woler (1800-1882) pelkistämällä sulaa berylliumkloridia metallikaliumilla.
Claprot oli analysoinut Perun vihreää jadea, mutta hän ei ollut löytänyt berylliumia. Bergman analysoi myös vihreää jadea ja päätteli, että se oli alumiinin ja kalsiumin silikaatti. 1700-luvun lopulla kemisti Warkeland suoritti krysoberyylin ja beryllin kemiallisen analyysin ranskalaisen mineralogin Ayuyn pyynnöstä. Walkland havaitsi, että näiden kahden kemiallinen koostumus oli identtinen, ja havaitsi, että se sisälsi uuden alkuaineen, kutsuen sitä Gluciniumiksi, substantiiviksi kreikan sanasta glykys, joka tarkoittaa makeaa, koska berylliumin suoloilla on makea maku. 15. helmikuuta 1798 Vokland luki paperinsa uusien elementtien löytämisestä Ranskan tiedeakatemiassa. Koska yttriumsuoloilla on myös makea maku, Wühler nimesi sen myöhemmin Berylliumiksi, joka on johdettu englanninkielisestä nimestä beryl, berylliumin päämalmista.